本研究中心團隊成員於第一期共計爭取非屬政府部門的145件產學合作計畫案，五年成長率為194%；總金額達6千356萬餘元，五年成長率為125%，與產業合作互動緊密，且團隊成立4間衍生新創公司，募資超過2.4億元資本額，獲得36項專利、取得31項技轉案，產業化績效卓著。
-
益生菌與酵素代謝物配合植生劑於鴨隻飼糧之應用(產學案108D562)
本中心成員李滋泰教授「功能性益生菌及酵素代謝物作為飼料添加物之技術及用途」輔導及技轉9間牧場，累計技轉金390萬元，教授輔導福華畜牧場以多種枯草桿菌作為強大環境耐受性之益生菌，配合酵母菌複合配方作為蛋鴨飼料營養添加物，可增進蛋鴨增重達13%並使飼料換肉率提升15%，同時建構良好的腸道型態及菌群，增加其對養分之吸收與提升腸道乳酸菌數量，降低腸道內大腸桿菌及糞中臭味，改善環保問題。
-
酵母菌量產脂肪酶與α-半乳糖酶於仔豬飼料添加之產業應用
本中心共同主持人劉宏仁教授輔導農鶴公司以發酵槽生產酵素蛋白，研究團隊開發具葡萄糖轉運蛋白啟動子之酵母菌表現系統及以pirl鑲嵌蛋白將lipase 及α-galactosidase呈現於酵母菌細胞壁表面之表面呈現系統。以葡萄糖作為誘導劑之酵母菌表面呈現系統，取代傳統以甲醇誘導蛋白表現。將酵素呈現於酵母菌細胞表面，增加脂肪酶與α-半乳糖苷酶之活性及穩定性及減少破菌純化之步驟及成本。協助企業提升技術能力及增加產值。
-
益生菌技術移轉：
子計畫三團隊與國家衛生研究院及農委會畜產試驗所組成三方合作團隊之研發成果「具表現5-甲氧基色胺酸之乳酸菌」於109年底技轉給味丹企業股份有限公司，總技轉金800萬元，分階段給付，另有上市商品營業額2%之權利金。110年度已完成簽約，並已給付簽約金100萬元。
-
跨主軸產學合作：
本團隊李宗翰共同主持人與子計畫三主持人陳彥伯助理教授合作，添加益生菌於水產機能飼料的添加物為研發重點，並探討是否增加魚類生長及抗逆境能力。金目鱸為台灣主要養殖的經濟魚種之一，且已是本團隊作為學術研究的使用魚種，同時已有全基因組的序列，因此從人力及養殖場所能夠以最低成本進行相關產學合作研究。試驗成果將作為未來飼料添加物實驗的基礎。
-
功能性胜肽開發之新創公司:
本研究中心總主持人陳全木教授團隊所衍生的中化健康生技股份有限公司，為一間師生共同創業的新創團隊衍生公司，利用動物生物科技領域之專長，從事有關於功能性胜肽開發與醫藥蛋白之生產平台、抗菌與抗病毒及免疫調節之動物與人體健康探究，針對老齡化族群之心血管與骨質保健的預防醫學、提升人體與動物抗病力的蛋白與胜肽開發等重要面向，公司設立於台中科學園區，資本額為1億元；聚焦在功能性胜肽於預防醫學與醫藥領域應用，產品於國內外市場銷售，造福國人健康及提升經濟動物產業之競爭力。
-
幹細胞無血清培養基之新創公司:本中心成員蘇鴻麟教授團隊所組成的通用幹細胞股份有限公司，為一間師生共同創業的新創團隊，主要經營人類與動物幹細胞培養液之生產與銷售，已成功取得ISO 9001及ISO 13485兩項認證，於110年10月28日登錄台灣股市的創櫃版。其產品無異種來源、無血清且具價格競爭優勢，可解決客戶過去細胞量產流程複雜、需要檢驗異種病毒且價格高昂之問題。資本額為1.4億元；此一新創公司獲得國家新創獎，並參與110年在台北南港展覽館舉辦的「2021亞洲生技展」。
-
台灣土雞三元雜交育種技術之新創公司:
本中心成員陳志峰教授團隊所組成的《瑞興農業生技股份有限公司》，是一間師生共同創業的台灣土雞新世代創業公司，主要經營家禽飼育、本土雞與有色雞之繁殖育種。從事畜牧技術服務之行業，如家禽孵育、家畜禽配種、 家畜剪毛、蛋類選洗包裝。由本中心技術轉移遺傳性狀優良的興大土雞101品系進行三元雜交育種，培育出毛色豐富的ACD商用雞；初期創業資本額為300萬元；陳志峰教授於2019年榮獲「全國十大傑出農業專家」。
-
乳酸菌新式乳製品之新創公司:
本研究中心子計畫三成員陳彥伯老師與子計畫六的師生所組成的新創團隊，成立《日果乳坊 (LaitGood)股份有限公司》，核心技術為新式茶風味乳製品之開發。目前已將兩個子計畫三與子計畫六於本計畫前四年(107-110年)所研發出來的成果，開發成為「茶優格」的營養保健商品，並於2022年9月正式完成募資與登記成立新創公司，目前已有多項產品上市。
